Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms