Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA11P31270 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA11P31270 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms