Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHP20396 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHP20396 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRHP20396 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRHP20396 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRHP20396 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRHP20396 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms