Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB1P16220 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CREB1P16220 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms