Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMDP11532 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMDP11532 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DMDP11532 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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