Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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