Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRTO4Q9UKD2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms