Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms