Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF17Q9BXT8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms