Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms