Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms