Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE22Q8NFJ8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms