Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPAP2Q8IXW5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms