Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNDC1Q76NI1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNDC1Q76NI1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms