Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP1Q702N8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP1Q702N8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms