Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFPL4BQ6ZWI9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RFPL4BQ6ZWI9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms