Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LDLRAP1Q5SW96 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms