Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms