Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSPP1Q1MSJ5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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