Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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