Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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