Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms