Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3GAP1Q15042 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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