Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN3Q13286 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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