Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJA4P35212 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJA4P35212 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJA4P35212 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJA4P35212 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJA4P35212 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms