Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLD1P28340 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms