Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NFKBIAP25963 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms