Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA1P25391 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms