Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DMDP11532 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMDP11532 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMDP11532 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMDP11532 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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