Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPBP07199 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPBP07199 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPBP07199 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPBP07199 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBP07199 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms