Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHANK2Q9UPX8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHANK2Q9UPX8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms