Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRAPPC2LQ9UL33 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms