Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMBRD1Q9NUN5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMBRD1Q9NUN5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms