Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SALL3Q9BXA9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms