Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF248Q8NDW4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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