Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT28Q7Z3Y7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms