Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms