Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms