Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms