Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPEGQ15772 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms