Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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