Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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