Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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