Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms