Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms