Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms