Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM193AP78312 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms