Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACTA1P68133 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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