Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP107P57740 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms