Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XCR1P46094 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
XCR1P46094 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XCR1P46094 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms